ثبت نام در دوره جدیددر حال برگزاری

داکینگ مولکولی

کد دوره A101 مدت دوره 20 ساعت
تاریخ شروع دوره پنجشنبه، ۱۸ آذر ۹۵ تعداد جلسات 4 جلسه
شهریه دوره ۲۰۰,۰۰۰ تومان ظرفیت 30 نفر
استاد دکتر سید شهریار عرب عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس

کلاس ها به صورت مجازی آنلاین روز های پنج شنبه و جمعه ساعت 19-15برگزار می شود.

روز 18 آذرماه جلسه آموزش نحوه استفاده از سیستم در ساعت 15-14برگزار خواهد شد.

به دانشجویان در حال تحصیل 30 درصد تخفیف تعلق می گیرد.

دانشجویان محترم پس از ثبت نام در سایت، لطفا اسکن پشت و روی کارت دانشجویی خود را از طریق منوی حساب کاربری خود با انتخاب گزینه ارسال مدارک، برای ما ارسال نمایید.

داکینگ روشی است که جهت گیری ترجیحی (Preferred orientation) یک مولکول نسبت به دیگری را زمانی که به یکدیگر متصل می شوند تا کمپلکسی پایدار را شکل دهند، پیشگویی می کند یا به عبارتی روش کلیدی در پیش­ بینی ساختار کمپلکس رسپتور-لیگاند در فرایند کشف داروها و ترکیبات پیشرو جدید، داکینگ مولکولی نامیده می­ شود. این تکنیک برای اولین بار اواخر سال ۱۹۸۰ مورد استفاده قرار گرفت و امروزه به طور گسترده به عنوان ابزار جستجوی مجازی در مراحل اولیه فرایند توسعه دارو به کار برده می­ شود. علاوه بر این، روش داکینگ مولکولی روشی ارزشمند برای شناخت بهتر برهم ­کنش ­های رسپتور-لیگاند است. با پیشرفت علوم و تکنولوژى, استفاده از علوم بین رشته اى مانند بیوانفورماتیک رشد روز افزونى داشته است و این امر به علت امکان صرفه جویى در وقت و هزینه مى باشد. همچنین استفاده از تکنیک هاى بیوانفورماتیک , تحقیقات و مطالعاتى را که عملا از نظر آزمایشگاهى انجام آن امکان پذیر نیست را میسر مى سازد .

اهداف :

ایجاد توانایی در دانش پذیران به منظور آشنایی با تکنیک های طراحی دارو، آشنایی با انواع روش های داکینگ، توانایی در آنالیز و تفسیر نتایج داکینگ ، توانایی در طراحی و تعریف پروژه های تحقیقاتی طراحی دارو ، طراحی و بکارگیری روش داکینگ در جهت کشف و طراحی داروی جدید

مخاطبان دوره:

محققین، فارغ التحصیلان و دانشجویان رشته های علوم زیستی پایه و بالینی، داروسازی و پزشکی و کشاورزی

نحوه برگزاری:

     دوره آموزشی داکینگ مولکولی صرفا مجازی بوده در 4 جلسه 4 ساعته ارائه می شود و یک جلسه 4 ساعته نیز پس از آن جهت رفع اشکال اختصاص می یابد که به شرح ذیل بیان شده است. لازم به ذکر است از فراگیران در پایان ، آزمون به صورت اینترنتی توسط سامانه آزمون مرکز گرفته خواهد شد و به افرادی که در آزمون پایانی موفق به کسب حداقل 60 درصد نمره کل شوند، مدرک معتبر (Bioinformatics operator in molecular docking) به زبان انگلیسی از مرکز اعطاء می شود. همچنین در صورتی که فراگیری حدنصاب لازم را کسب ننماید می بایست مبلغ 500/000 ریال هزینه جداگانه جهت شرکت در آزمون مجدد را پرداخت نموده و در صورت کسب نمره حداقل مذکور، مدرک دریافت نماید. این امکان فقط یک بار تکرار می شود و در صورت عدم کسب نمره حداقل، هیچ گونه مدرکی برای فراگیر صادر نخواهد شد.


سرفصل ها:

  • آشنایی با بیوانفورماتیک مقدماتی و لینوکس

آشنایی با بانک اطلاعاتی ساختاری پروتئین ها (Protein Data Bank)

معرفی فرمت ذخیره سازی اطلاعات ساختار مولکولها

نرم افزارهای نمایش ساختار مولکولی

آشنایی با مبانی سیستم عامل لینوکس و فرامین ترمینال

نحوه اتصال به سرور از طریق اینترنت ( نرم افزارهای putty  و winscp)

  • داکینگ مولکولی - پروتئین و لیگاند

معرفی داکینگ

(Rigid Docking)

کار با نرم افزار  Autodock و نرم افزار MGLTools

آماده سازی اولیه فایلهای ورودی

اجرای Autogrid و Autodock

آنالیز نتایج

(Flexible Docking)+ آنالیز

معرفی نرم افزار Ligplot

  • داکینگ مولکولی - غربالگری مجازی

دیتابیس مولکولهای دارویی

کار با نرم افزار Autodock Vina جهت Virtual Screening



وسایل مورد نیاز داوطلبان جهت شرکت در دوره:
  • اینترنت با سرعت حداقل 256 Kbps
  • داشتن اسپیکر و میکروفون
  • Webcam

اطلاعات تکمیلی جهت حضور در کلاس مجازی آنلاین 48 ساعت قبل از شروع دوره از طریق ایمیل برای شرکت کنندگان ارسال خواهد شد.


شیوه‌های پرداخت مبلغ قابل پرداخت تخفیف
بدون تخفیفسرسید پرداخت ۲۰۰,۰۰۰ تومانهنگام ثبت سفارش   
ویژه دانشجویانسرسید پرداخت ۱۴۰,۰۰۰ تومانهنگام ثبت سفارش ۶۰,۰۰۰ تومان